反撃の始まり
動物による一連の襲撃事件の後、ジャクソンは、この恐るべき不可解な事件と、近い将来の破局を唱えた父の仮説とがつながる可能性に気づく。
闘争または逃走
ライオンに襲われた友人のエイブラハムを助けたジャクソンは、背筋も凍る事実に気づく…。動物たちは、殺人を楽しんでいる。
蝉たちの沈黙
ジャクソンは父の調査資料を集めるべく日本に渡るが、彼の乗った飛行機が、コウモリの群れにより不時着させられる。
群れの心理
ジャクソン、エイブラハム、クロエ、そしてミッチは、謎の政府関係者にスカウトされ、動物による襲撃の原因を突き止めるよう依頼される。
マザー・セル
ジャクソンは、動物による襲撃と、ある巨大バイオテクノロジー企業とを結びつける証拠を持つ科学者を捜す。
この音を聴け
ミッチとクロエは、リオデジャネイロでコウモリの大発生を調査していて、ブラジルの麻薬王に捕まってしまう。
眠れる森のクマ
パリで1頭のクマが発見された。チームはそのクマの群れの残りを、冬眠しているうちに見つけようと急ぐ、
ゴーストバスターズ
殺人ネズミでいっぱいの貨物船が、海岸に流れ着く。チームは、この危険なネズミがこれ以上繁殖するのを防がなければならない。
悲しみの黒い鳥
デラヴェインに関するショッキングな事実が分かった後、チームはある記者に接触し、レイデン・グローバル社に関する真実を公表しようとする。
逃亡者
チームはザンビアに向かう。世界規模で広まった動物の異常行動の、治療薬ができるかもしれないのだ。
怪獣たちのいるところ/神の雫
ザンビアでの反乱者たちとのいさかいでジャクソンが負傷し、チームは急いで彼をジンバブエの病院に連れていく。しかし、病院は野生動物に制圧されていた。
絶望と希望のあいだ
動物の異常行動を治すべく、チームは追い込みにかかる。しかし、予期せぬ障害により、すべての努力が水泡に帰してしまうかもしれない。
獣の日 / 変異する人間
チームはジェイミーを救出するべくカナダへ向かい、各地で発生する動物の襲撃を食い止めるため、その手がかりとなる遺伝子を持つ可能性があるヒョウを追う。一方、アルゼンチンで究極の捕食者へと変異した医師を調査するチームは、彼の餌食となる危機に直面する。
発電アリの暴走
チームは動物の襲撃からジュネーブの街を守る。一方でチームの新メンバーは、ノア計画のトップであるデイヴィスに関する衝撃的な情報を知る。
鍵を握るナマケモノ
デイヴィスとノア計画に関するさらなる情報を手に入れるべく、チームはレイデン社に潜入する。
黒い涙
なんとかキャラキットにたどり着いたジェイミーとローガンだが、そこは安全とは程遠い場所だった。
嵐を呼ぶクラゲ
チームは治療法解明に向けた決定的な手がかりを得るために、リスボンで毒物を売買する凶悪な男に接触する。
ゴースト
チームがイギリスで三重らせん構造の遺伝子に関する手がかりを探る一方、ミッチは治療法解明のヒントを求めてジャクソンの過去を調査する。
襲撃
ジャクソンの母親が行方不明となりチームは捜索のためアフリカに向かうものの、飛行機に侵入していたデイヴィスと傭兵たちが彼らの前に立ちふさがる。
父の罪
三重らせん構造の遺伝子を持つ最後の骨をめぐり、チームの探索は不可能にも思える結論へと達し、ジャクソンは苦渋の決断を迫られる。
再会
ミッチとエイブラハムは姿を消したジャクソンを追う。一方でジェイミーとダリエラはロシア政府にノア計画を放棄するよう懇願する。
未来をかけた闘い
ジャクソンは意外なところから探し求めていた情報を手に入れる。一方ミッチとジェイミーはロシア大使館で動物に襲撃される。
パンゲア / 絶望の時代
ミッチとジェイミーはノア計画を廃止させ世界規模の大惨事を防ぐため、大胆な作戦に乗り出す。ついに治療薬の材料が揃うと、チームは世界の危機を救うべくパンゲア島に集結する。
さまよえる人類
人造種という新たな脅威が登場する。
偽物の娘
ポートランドとニューヨークで起きた二つの爆破事件をつなぐ共通点が判明する。
失った10年
息子を連れ去られたエイブラハムとダリエラはレイデン社から取引を持ちかけられる。一方、ジェイミーとクレメンタインはミッチの体内から謎の装置を見つける。
火の鳥
人造種からニューヨークを守るべく、チームは再集結する。
奇跡の子
ジェイミーは逮捕されながらも、人類を不妊化させた謎の組織「シェパーズ」の追跡へ向け、ミッチとローガンの力を借りる。
オズの猛獣使い
クレメンタインを救い出そうとするミッチ。そしてジャクソンの妹の過去が、人造種誕生の起源を知る手がかりとなる。
消える大蛇
新たな人造種に関する情報を探るため、ミッチとジェイミーはペルーへ向かい、そこで彼らとゆかりのある人物と遭遇する。
決死の空中戦
人造種が引き起こした電気系統のトラブルによって、チームの飛行機は墜落の危機に直面する。
6番目の人造種
ミッチの別人格ダンカンが、チームの飛行機から吹き飛ばされた。ジェイミーたちは彼を捜索する。
デッドマンスイッチ
ジャクソンは、重傷を負ったアビゲイルの命を救おうと試みる。
闇に差す光
毒性の芽胞が飛行機に迫り、チームが機内から出られずにいる一方、クレメンタインには出産が迫り、事態は混迷を深めていく。
滅亡へのカウントダウン
飛行機が人造種エリアに不時着し、ダリエラとテッサが救出に向かう。
最後の戦い
チームは人造種を引き寄せるビーコンを止めることで、人造種による防護壁突破の阻止を試みる。